五代十國時(shí)，戰(zhàn)亂迭起，昭覺寺僅存房舍五間，田土三百廛。后殿堂衰頹，寺廟荒蕪。北宋真宗大中祥符元年(1008年)，休夢(mèng)法師五世法嗣延美禪師住持昭覺，用了30多年的時(shí)間進(jìn)行全面修復(fù)，殿堂房舍增至300余間，建有大雄寶殿、唱梵堂、羅漢堂、六祖堂、翊善堂、列宿堂、大悲堂、輪藏閣等主體建筑，塑像、畫像、碑記、寺額等恢復(fù)舊貌。寺內(nèi)經(jīng)濟(jì)實(shí)力雄厚。李畋《重修昭覺寺記》中載道：供食之豐潔，法席之華煥，時(shí)一大會(huì)，朝飯千眾，累茵敷座，未有一物，愛假外求。神宗元豐末年(1085年)，禪宗臨宗禪師純白任昭覺寺住持，開堂說法，從者甚多，被稱為西川第一叢林。宋徽宗崇寧年間(1102-1106年)及南宋產(chǎn)高宗紹興初年(1131年)，圓悟克勤(原號(hào)佛果克勤)兩度住持昭覺寺，紹興五年(1135年)在昭覺寺圓寂。至今寺內(nèi)尚存圓悟禪師墓。圓悟克勤所著《圓悟心要》、《茶禪一味》傳入日本和東南亞各國，日本人至今把《茶禪一味》尊為茶道至寶。