文廟原稱孔廟，原為春秋時期儒教創(chuàng)始人孔子(名丘，字仲尼)的家廟，故稱孔廟。從唐玄宗賜封孔子為“文宣王”以后，孔廟就被改稱“文宣王廟”，并詔令全國各州縣依制隆重奉祀。明代因與武廟(關(guān)帝廟)對應(yīng)，改稱“文廟”。在滄桑歲月中，平遙文廟曾經(jīng)歷過三移其址的風(fēng)雨。據(jù)清光緒八年(1882年)《平遙縣志》載：明崇禎九年(1636年)，時任知縣王凝命上任祭拜孔廟后說，文廟隔街背對著“太子寺”，太子貴為儲君，而孔子再高貴也屬臣僚之列，臣廟居于君寺之前，有悖禮制，大不敬也!便強令互換，文廟改做太子寺�！逼鋵�，太子寺是一佛教寺院，因佛祖釋迦牟尼出家前是古印度迦毗羅衛(wèi)國的王太子而得名，與儒教之文廟純屬風(fēng)馬牛不相及。這位王知縣是云南昆明人，賜進(jìn)士出身．可謂孔子的“高徒”，卻如此迂腐�？h士紳雖明知荒唐，卻畏其權(quán)勢，不敢與之爭，哭笑不得�！盎恼Q鄙俚最為不經(jīng)，侮圣褻賢，不知其意之所在，相沿數(shù)十年，生儒抱恨不能更定。至康熙十四年知縣柏鄉(xiāng)魏裔愨至，詢得其由，按圖考察，慨然興作，祥具各憲，仍以故寺為寺，而建新廟于舊所，闔邑稱快�！�(《平遙縣志-學(xué)校志》)這樣，至清康熙十四年(1675年)，才由知縣魏裔愨(直隸柏鄉(xiāng)縣舉人)移改。平遙的一件“糊涂官辦糊涂事”的千古奇案，自此方得了結(jié)。

　　而據(jù)明萬歷三十七年(1609年)《汾州府志》載：“平遙縣儒學(xué)，舊在縣治東。嘉靖八年(1529年)，巡按穆公準(zhǔn)呈，以前太子寺更之�！庇謸�(jù)清乾隆三十六年(1771年)《汾州府志》載：“崇禎九年，知縣王凝命，復(fù)以文廟與太子寺互更。國朝康熙十四年，知縣魏裔愨，按嘉靖八年以后移改。”說明在明嘉靖八年前，現(xiàn)在文廟址上本為佛教的太子寺，其北面的太子寺(已毀)，才是最早的平遙文廟舊址。因而現(xiàn)存金大定三年重修的“大成殿”，最早應(yīng)當(dāng)也是佛教殿宇，其后墻上現(xiàn)存的后壁中門檁及門形仍存，似為佛教寺院的“中殿”格式，也是歷史上“文廟三遷”的痕跡。

　　平遙文廟歷來為縣學(xué)所在，直至清光緒末年廢除科舉后，縣學(xué)才停，改辦為“平遙縣實業(yè)學(xué)校”，開始了新學(xué)。到1923年，一些商賈財東捐資在文廟辦起了“平遙勵志中學(xué)�！保�縣長郭學(xué)謙還題寫了校名門額，后改為官辦平遙中學(xué)校，遷址到察院街。1950年，太岳中學(xué)同平遙中學(xué)合并，校址又設(shè)在文廟，其建筑基本保存著原貌，只拆除了欞星門、西學(xué)、省畜所。20世紀(jì)50年代末，修建平遙中學(xué)教學(xué)樓時，拆除了超山書院、敬一亭、尊經(jīng)閣。1997年平遙古城被列為世界文化遺產(chǎn)，平遙文廟也被列為全國重點文物保護(hù)單位。在中共平遙縣委、縣政府、平遙中學(xué)和上級有關(guān)部門的大力支持下，平遙中學(xué)于2003年全部遷至東城外新校址。文廟得以重新復(fù)原，成為平遙古城的主要文物旅游景點之一，2004年正式向游人開放。