該館總投資約2億元，整體建設(shè)用地達(dá)12.9萬(wàn)平方米，控制用地10萬(wàn)平方米，總建設(shè)面積1.75萬(wàn)平方米。由廣州一家建筑設(shè)計(jì)有限公司精心制作而成，創(chuàng)意緊扣海的主題，而且功能、結(jié)構(gòu)、形式、文化內(nèi)涵高度統(tǒng)一。由五個(gè)不規(guī)則的大小橢圓體連環(huán)相扣組成，外形猶如古船的龍

　　中間最大橢圓體為“水晶宮”。用來(lái)盛放古船“南海一號(hào)”，它是一個(gè)巨型玻璃缸，水深12米，因而被形象地稱之為“水晶宮”。這些水的水質(zhì)、溫度及其環(huán)境都與其所在海底位置完全一樣。2007年12月22日，“南海一號(hào)”整體打撈出水。古船是尖頭船，長(zhǎng)度為26米以上，寬度10余米，船身(不算桅桿)高8米，排水量約600噸，載重可能近800噸。26日已將它與船載物品和淤泥一起，被平移到這個(gè)巨型玻璃缸中。游客在博物館里可以通過(guò)地下一層的水下觀光廊透明墻壁環(huán)繞參觀。