昌珠寺珍珠唐卡為鎮(zhèn)寺之寶，所畫的是堅(jiān)期木尼額松像(觀世音菩薩憩息圖)。整個(gè)唐卡長(zhǎng)2米，寬1.2米，共耗珍珠26兩(計(jì)29026顆)，鑲嵌鉆石一顆，紅寶石二顆，藍(lán)寶石一顆，紫寶石0.55兩，綠松石0.91兩(計(jì)185粒)，珊瑚4.1兩(計(jì)1997顆)，黃金15.5克。

　　昌珠寺系吐蕃時(shí)期第一批興建的佛教寺廟之一，地當(dāng)昌珠區(qū)治所。這兒林木蔥蘢，風(fēng)景絕佳，古往今來一直是山南的政治經(jīng)濟(jì)中心之一。

　　昌珠寺建于松贊干布時(shí)期。傳說文成公主用五行算法算出妖魔羅剎女的一臂在貢布日山的西南方向，需建一寺鎮(zhèn)壓，方能保證國(guó)運(yùn)昌盛，而那兒是一大湖，湖中有一五頭怪龍?jiān)谂d風(fēng)作浪，于是松贊干布即在貢布日修法，終成正果，遂令大驚鳥降伏了怪龍，湖水也隨之干涸，昌珠寺亦即在此建成。傳說帶有濃厚的神話色彩，但是將昌珠寺和松贊干布、文成公主及大昭寺聯(lián)系在一起，至少說明關(guān)于該寺始建于松贊干布時(shí)期的說法是可信的。

　　昌珠寺最早的建筑，是現(xiàn)主寺對(duì)面的小殿，名“乃定拉康”，習(xí)慣上則常稱“乃定學(xué)”（第一層）、“乃定當(dāng)”（頂層）。乃定學(xué)東西長(zhǎng)10.2米，南北寬7.3米，內(nèi)有六柱。殿內(nèi)后壁原供奉佛像甚多，本尊則為松贊干布。乃定當(dāng)與乃定學(xué)范圍相同，本尊為蓮花生。據(jù)說這幢早期建筑當(dāng)年是用“貝瑪”草堆砌起來的，而現(xiàn)在的建筑則是石木結(jié)構(gòu)，說明是晚期修繕的格局。

　　昌珠寺最初的規(guī)模很小，據(jù)說只有六門六柱和祖拉康，以后該寺在原有建筑上曾經(jīng)三次大規(guī)模的修繕和擴(kuò)建。