本區(qū)地處鄂爾多斯臺(tái)地的西南隅，南接黃土生陵區(qū)，地貌屬于丘陵地帶，分為低山丘陵、緩坡丘陵和沙漠低山丘陵，海拔高度1150-1650米之間。區(qū)內(nèi)荒漠植被保存良好，尤其是中部核心區(qū)內(nèi)分布的以檸條為主的1.7萬(wàn)公頃天然荒漠灌木群落是國(guó)內(nèi)面積最大最集中的特有類(lèi)型，北部核心區(qū)內(nèi)2萬(wàn)公頃以貓頭刺為主的天然荒漠草原群落也是國(guó)內(nèi)已建保護(hù)區(qū)中最大的一處。區(qū)內(nèi)已知高等植物有49科149屬262種；已知脊椎動(dòng)物有22目45科115種，其中列為國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)的野生動(dòng)物有黑鸛、荒漠貓、兔猻、鵝喉羚、鳶等22種。本區(qū)北界距銀川市不到10公里，西界距黃河5棗10公里，特殊的地理位置起著特殊的不可替代的作用，對(duì)銀川市的生態(tài)環(huán)境的改善和減少北部沙漠對(duì)黃河的影響起著極為重要的作用。另一方面，保護(hù)區(qū)內(nèi)荒漠景觀獨(dú)特，并分布有距今3棗4萬(wàn)年的水洞溝古人類(lèi)文化遺址、宋代建筑馬鞍山甘露寺、明代古長(zhǎng)城等名勝古跡，對(duì)開(kāi)展生態(tài)旅游也具有重要意義。