滿人入關(guān)后，清政府下令封禁長白山，因為滿族相信長白山天池是自己的起源地。因此，在清朝末年之前，整個長白山地區(qū)被當(dāng)做圣地對待，任何毀壞都要受到重罰。

　　當(dāng)?shù)乜h志里有過記載：康熙當(dāng)朝時，曾派大臣武穆納來長白山祭祖。走到訥殷部的舊址所在地——今天的白河林場，就被蒼郁的樹林阻礙，無法前進，只能遙拜而歸。

　　清亡后，長白山陷入戰(zhàn)亂和劫難。日軍占領(lǐng)時期，長白山成為重要的木材輸出地，樹林成片消失。直到今天，當(dāng)?shù)厝诉�能準(zhǔn)確地指出日本人為了修建軍車通道而砍倒樹林的地方。

　　保護區(qū)成立以后，長白山能提供的經(jīng)濟資源，也成為當(dāng)時調(diào)研報告中的重要內(nèi)容。一份官方報告詳細(xì)列出長白山能提供的經(jīng)濟產(chǎn)品：價值達1億元的木材、各種毛皮、獸骨和中藥，以及可供食用的動植物和觀賞花卉。

　　天災(zāi)和人禍相繼煎熬著這個物種寶庫。1976年，臺風(fēng)從朝鮮半島登陸，刮倒了保護區(qū)里的許多大樹。