本區(qū)地處黑龍江與烏蘇里江匯流的三角地帶，屬低沖積平原沼澤濕地，為三江平原東端受人為干擾最小的濕地生態(tài)系統(tǒng)的典型代表，也是全球少見的淡沼澤濕地之一。區(qū)內泡沼遍布，河流縱橫，自然植被以沼澤化草甸為主，并間有島狀森林分布，均保持著原始自然狀態(tài)。保護區(qū)內特殊的自然環(huán)境，良好的植被和水文條件為各種野生動物提供棲息和繁衍場所，據初步調查，共有脊椎動物291種，其中獸類5目12科37種，鳥類15目167種，爬行類2目3科5種，兩棲類2目 2科5種，魚類9目17科77種，列為國家一級保護的野生動物有白鸛、丹頂鶴，白尾海雕等9種，列為國家二級保護的野生動物有大天鵝、白枕鶴、雷鳥、水獺、猞猁等32種。區(qū)內野生植物資源也比較豐富，有高等植物近500種，其中野大豆、黃菠蘿、水曲柳被列為國家二級保護野生植物。三江保護區(qū)的建立，對于保護濕地生物多樣性具有極為重要的意義，并為東北地區(qū)的氣候調節(jié)，水源涵養(yǎng)，洪澇災害控制及工農業(yè)生產和人民生活安全提供了重要保障。同時，本區(qū)與俄羅斯的三個保護區(qū)相鄰，在國際合作方面也具有十分重要的意義。