本區(qū)地處黃海之濱，境內(nèi)擁有大面積的灘涂、沼澤、鹽堿地，動植物資源豐富，區(qū)系成分復雜，自然植被主要由白茅、蘆葦?shù)葍?yōu)勢種類組成，維管束植物有223種。動物有獸類20多種，鳥類182種、兩棲類和爬行類27種，魚類150種、棘皮動物10種、環(huán)節(jié)動物62種，腔腸動物8種、浮游動物98種，具有典型的沿海灘涂濕地生態(tài)系統(tǒng)及其生物多樣性。1986年8月，林業(yè)部和世界野生生物基金會（wwf）合作從英國倫敦的七家動物園引種39頭麋鹿到保護區(qū)，經(jīng)過10年的努力，使麋鹿種群發(fā)展到268頭，在麋鹿的回歸引種、人工馴養(yǎng)繁殖和野化上取得了重大進展。除了主要保護對象麋鹿外，保護區(qū)內(nèi)屬于國家一級保護動物的有大天鵝、河鹿等19種，屬于中日候鳥保護協(xié)定的鳥類有95種，為候鳥重要越冬地之一。大豐麋鹿保護區(qū)的建立，不僅對麋鹿的回歸引種發(fā)揮了巨大的作用，同時對我國其它珍稀瀕危野生動物的人工馴養(yǎng)繁殖和回歸自然提供了可資借鑒的經(jīng)驗。