遺址位于距蒲廟鎮(zhèn)西南三公里的頂螄山，東面為清水泉下游，西北有邕江支流八尺江，整個(gè)遺址呈西南與東北走向，東西長約100米，南北長約60米，面積4800平方米，遺址橫斷面可見40—50cm厚螺殼堆積，采集標(biāo)本有蚌刀、石斧、夾砂粗陶片及多種獸骨。該遺址于1994年8月發(fā)現(xiàn)，1997年４—７月由中國社會(huì)科學(xué)院考古研究所廣西工作隊(duì)、廣西壯族自治區(qū)文物工作隊(duì)和南寧市博物館對(duì)該遺址進(jìn)行了為期４個(gè)月的發(fā)掘。1997年7月3日公布為縣級(jí)文物保護(hù)單位，并立有保護(hù)碑記，劃定了保護(hù)范圍：南以木棉樹為界，東、西、北以現(xiàn)有的魚塘邊為界。頂螄山貝丘遺址地層堆積清楚，文化內(nèi)涵豐富，有較高的學(xué)術(shù)價(jià)值，被評(píng)為該年度全國十大考古新發(fā)現(xiàn)之一。2000年7月自治區(qū)人民政府將頂螄山貝丘遺址公布為第五批區(qū)級(jí)文物保護(hù)單位。經(jīng)考古專家論證，依據(jù)考古學(xué)文化命名的原則，把集中分布在南寧及其附近的以貝丘遺址為特征的一類遺址統(tǒng)一命名為“頂螄山文化”，這是中國原始文化序列中我區(qū)第一個(gè)被冠以廣西地名命名的史前文化。2001年7月國務(wù)院公布頂螄山貝丘遺址為全國第五批國家級(jí)文物保護(hù)單位，這是南寧市（含邕寧、武鳴等七縣）首個(gè)獲得這一級(jí)別的文物保護(hù)單位。