明代成化十八年（1482），憲宗賜寺名“顯教寺”。明代《孝宗實(shí)錄》卷一○六和一○七中也有該寺番僧遠(yuǎn)丹堅(jiān)于弘治十三年（1500）三月丁卯入京朝貢，并于弘治十四年（1501）八月戊辰請(qǐng)襲國(guó)師之職的記載，明制國(guó)師可直接貢物京師，可見(jiàn)顯教寺在15、16世紀(jì)已成為地位較為顯赫的藏傳佛教寺院。

　　建于永樂(lè)九年（1411年）的大雄寶殿是顯教寺現(xiàn)存的唯一一座明代建筑，有著近六百年的歷史，也是連城最早的一處建筑。大雄寶殿，建筑面積158平方米。為歇山頂建筑，下施雙昂斗拱，整體穩(wěn)重而不失輕盈，具有典型的明代建筑風(fēng)格。其花格門(mén)上的“大香瓣”木雕仍為原跡。大殿保存有大量的明清建筑彩畫(huà)，其中天頂平綦彩畫(huà)96幅，拱眼壁畫(huà)94鋪，主要集中在諸佛菩薩、護(hù)法和曼陀羅等題材，繪制工細(xì)，設(shè)色艷麗，線條流暢生動(dòng)，具有濃郁的地域風(fēng)格和精湛的藝術(shù)水平，無(wú)論在佛教領(lǐng)域還是在美術(shù)史領(lǐng)域都有著極高的研究?jī)r(jià)值。