處于洞穴動物食物鏈頂端的兩種蝙蝠，分別居于兩個洞穴中(1號和2號)；1號寶角牛洞里的三葉小蹄蝠數(shù)量在100只以上，而2號洞里的大長舌果蝙蝠數(shù)量在30-40只。

　　洞穴環(huán)境中的食物的豐富程度，決定了洞穴動物多樣性的豐富程度。地處保護(hù)區(qū)內(nèi)的勐遠(yuǎn)洞穴區(qū)，洞外的原始森林生態(tài)系統(tǒng)完整、生物多樣性豐富，為這些蝙蝠提供了充足的食物；而如此大量居住并頻繁進(jìn)出洞穴的蝙蝠則又為洞穴里的其他洞穴生物提供了食物來源(包括蝙蝠從洞外帶入的食物殘渣、蝙蝠的糞便甚至蝙蝠自己死亡后的尸體)。因此，我們可以很容易地觀察到這樣的現(xiàn)象：洞穴里的蝙蝠糞便多的地點，穴居動物的種類和數(shù)量都多；尤其是腐食性的馬陸類和螺類、以及雜食性的斑灶馬。寶角牛洞是在當(dāng)?shù)匦〕朔鸾痰貐^(qū)有著一定影響的宗教朝拜洞穴，并在上世紀(jì)90年代作過建議的旅游開發(fā)，游客和朝圣者進(jìn)入洞穴后遺留下來的食物殘渣和火把殘木/竹，在洞穴內(nèi)的高濕條件下腐爛的很快，給那些腐食性動物帶來了豐富的食物，腐食性洞穴動物的種群數(shù)量得以大量增加。

　　洞穴與外界的聯(lián)絡(luò)方式?jīng)Q定了洞穴生物的豐富程度。2號洞是一個具有較大的洞穴空間和很多與外界直接聯(lián)通的開口，因此2號洞在4個考察的洞穴中，無論是洞穴動物的種類數(shù)量或種群數(shù)量都是最為豐富的；其次是雙開口的寶角牛洞。而單一開口的3號洞和4號洞相對貧少很多。

　　與地表上的生態(tài)環(huán)境影響不同，地下洞穴內(nèi)空氣中溫度對于洞穴動物多樣性中的洞穴物種和群落分布的影響不大。因為，除了靠近外界的洞口區(qū)域之外，在洞穴內(nèi)部，溫度值是恒定不變的(21°C)和均勻的，而且在同一地區(qū)的不同洞穴這一恒溫值是沒有差異的。

　　相比之下，洞穴環(huán)境因子中的濕度對于洞穴動物的分布有著一定的影響。洞穴斑灶馬是穴居動物代表性動物和常見種，也是數(shù)量上的優(yōu)勢種，而且見于洞穴內(nèi)除水域外的所有洞段，尤其是洞壁上。斑灶馬并不喜歡過于潮濕的洞壁，單過于干燥(濕度在65%以下)也幾乎沒有灶馬分布。倍足類動物馬陸對洞穴濕度的喜厭程度與灶馬相類似。洞穴濕度對洞穴生物的影響，在寶角牛洞和4號洞顯得更為明顯，在寶角牛洞里的一些處于高位、空氣濕度很低的干燥歧洞里，就沒有馬陸或斑灶馬。而單一通道的4號洞里的空間主要是河道，因此空氣濕度很大，加上陸地面積少、創(chuàng)造食物來源的土壤(淤泥)堆積少，故洞穴動物的種類和數(shù)量也很少。